Organisatie

HET KONINKLIJK MUSEUM VOOR MIDDEN-AFRIKA (KMMA)
Het Koninklijk Museum voor Midden Afrika (KMMA) biedt een functie aan voor een postdoctorale onderzoeker in het kader van een door de EU gefinancierde Horizon 2020 project “In-silico boosted, pest prevention and off-season focused IPM against new and emerging fruit flies ('OFF-Season' FF-IPM)" (https://cordis.europa.eu/project/rcn/223226/factsheet/en). Het project richt zich op drie zeer polyfage fruitvliegsoorten (FF: Diptera, Tephritidae) van groot agrarisch belang en die een onmiddellijke bedreiging vormen voor de Europese tuinbouw. De algemene doelstelling van dit project, waarbij 16 Europese en 5 niet-Europese partners betrokken zijn, is de ontwikkeling van ‘in-silico’ ondersteunde preventie, detectie en IPM (integrated pest management) methoden voor zowel nieuwe als gevestigde FF en dit gebaseerd op geografische modellen, nieuwe beleidsondersteunende systemen, en nieuwe kennis omtrent handel, socio-economische aspecten en biologische eigenschappen van de doelsoorten. Het project heeft een looptijd van vier jaar, vanaf september 2019. Als essentieel onderdeel van de ontwikkeling en verbetering van systemen voor vroegtijdige opsporing en melding zal het KMMA de leiding nemen in de ontwikkeling van moleculaire instrumenten en methoden om de oorsprong van onderschepte en gedetecteerde FF te identificeren. In dit kader willen we een aantal genomische methoden gebruiken in functie van de volgende doelstellingen:
https://www.africamuseum.be

Functieomschrijving

De medewerker zal de volgende taken en activiteiten uitvoeren en ondersteunen: • Voorbereiding van de DNA-bibliotheek voor High Throughput Sequencing (HTS) met inbegrip van whole genome sequencing, targeted amplicon sequencing en reduced representation genome sequencing (inclusief RAD / ddRAD-seq). • Analyse van HTS-gegevens (met inbegrip van data kwaliteitsfiltering, de novo assemblage en referentie mapping, SNP calling en populatiegenomica analyses) • Omzetting van de verkregen gegevens in identificatie-instrumenten voor het traceren van de oorsprong van de onderschepte FF specimens • Het testen van de robuustheid en doeltreffendheid van de ontwikkelde instrumenten • Communicatie met de bevoegde instanties, particuliere ondernemingen en het publiek ivm de behaalde resultaten en het gebruik van de ontwikkelde instrumenten • Het opstellen van wetenschappelijke communicatie en artikels in samenwerking met de wetenschappers van de KMMA onderzoeksgroep en de partners van het FF-IPM consortium

Profiel

De kandidaat moet aan de volgende eisen voldoen: • Doctoraat in populatiegenomica, phylogenomica, evolutionaire biologie of aanverwante disciplines • Goed vertrouwd zijn met scripting en analyse van HTS gegevens • Vertrouwd zijn met populatiegenomica analyses • Ruime praktijkervaring in ‘wet DNA’ laboratorium (inclusief voorbereiding van genomische libraries) Algemene vaardigheden • Teamspeler maar in staat om zelfstandig te werken • Goede communicatieve vaardigheden, waaronder het gebruik van moderne sociale media • Wetenschappelijke nieuwsgierigheid • Goede kennis van het Engels Pluspunten • Kennis van de tweede landstaal • Bewezen kennis binnen één of meer van de volgende disciplines: agrarische entomologie, taxonomie, Diptera

Aanbod

• Een voltijds contract voor twee jaar (tot 31 december 2022), met een eventuele verlenging voor de duur van het project. • Een loon conform de barema’s van de federale overheid voor een onderzoeksassistent (Minimum aanvangswedde SW11: 44.174,57 euro bruto geïndexeerd jaarsalaris) • Een interessante vakantieregeling. • Gratis woon-werkverkeer met het openbaar vervoer of fietsvergoeding. • Een aangenaam werkkader in een dynamische werkomgeving.
Categorie
Andere
Type
Vast
Tewerkstelling
Voltijds
Regio
Vlaams-Brabant